Lisabonos sutartimi įvedamos dvi ES išorės veiksmų atžvilgiu svarbios institucinės naujovės:
2009 m. lapkričio mėn. Europos Vadovų Taryba į Europos Sąjungos vyriausiojo užsienio reikalų ir saugumo politikos įgaliotinio pareigas ir vadovauti Užsienio reikalų tarybai paskyrė Catherine Ashton. Ji taip pat yra Europos Komisijos pirmininko pavaduotoja ir užtikrina, kad ES išorės veiksmai būtų nuoseklūs ir koordinuoti.
Vyriausiajai įgaliotinei padeda Europos išorės veiksmų tarnyba (EIVT). Joje dirba Europos Komisijos, Tarybos Generalinio sekretoriato ir ES valstybių narių diplomatinių tarnybų darbuotojai.